鸣海孝之（谷山纪章 配音）、平慎二（青木城 配音）和速濑水月（石桥朋子 配音）是学生时代的好友，毕业在即，三人亦即将奔向不同的未来。某日，鸣海孝之结识了名叫凉宫遥（栗林美奈实 配音）的少女，在速濑水月的牵线搭桥下，鸣海孝之和凉宫遥走到了一起。
案件被移交给了不知名的当事人Dang Masaya（户田惠莉卡饰演）和Setsumoto（加濑龙饰）。在调查过程中，两人接到了志村美玲（福田佐纪饰演）的求助电话，在赶往救援时，意外遇到了濑户（栗山千明饰演）的前同事兼情人青池惠子。当麻将美玲被带回未知的部门时，已经去世的杨泰/111（新木龙之介饰演）平静地出现在他们面前。马试图压制住她不安的左手，虚弱地看到美玲在被杨泰带走之前匆忙留言说“我们必须阻止法蒂玛的第三个预言”。在杨泰的恶意煽动下，普通人类与SPEC持有者之间的冲突变得越来越激烈。在两者之间的差距中，马对法蒂玛的第三个预言和人类未来的方向充满了困惑。玛丽亚，白衣教宗，左手拿着火焰之剑的天使。。。预言中的关键人物迫在眉睫，黑暗的未来最终会不可避免吗？
