鲁邦三世与次元大介为了得到秘宝“小小彗星”潜入东德洛阿。东德洛阿因为本国的著名歌手 玛尔塔在邻国西德洛阿被刺杀而与该国进入一触即发的紧张状态。鲁邦三世与次元大介成功得 到了“小小彗星”,但在逃走时,次元大介被狙击。 是谁狙击了次元大介?为了什么?看到穿过身体的子弹,次元注意到这与在西德洛阿被暗杀的 歌手的子弹是一样的。 次元大介与鲁邦一起来到墓地。两人惊讶地发现那里居然有“次元大介”的坟墓 ! 从这个信息次元大介推测出犯人,那就是在暗杀前会提前为死者准备坟墓的奥崎,没人能从他 的暗杀下逃出。 鲁邦与次元两人潜入奥崎的秘密小屋,从一间房间的屏幕上看到了被囚禁的不二子!这时,奥 崎出现。 对决的时刻来到了。打破静寂的枪声!被打中的是——! 再见了,次元……!
三人回忆起小学时光,约定到曾经的游泳馆去。在废弃的游泳馆里,他们居然遇到了归国的松冈凛(宫野真守 配音)。意料之外的是,昔日战友凛性情大变,还对遥发起挑战,结果遥输给了他。 遥、真琴和渚决定成立游泳部,经过多番努力后,终于招募到了新成员龙崎怜(平川大辅 配音),他们以县大赛冠军为目标,进行紧张的集训。另一方面,凛所在的鲛柄学院游泳部也在为大赛作准备。他们约定,要在赛场上决一高下。充满激情和活力的游泳部,在这个夏天,开始了关于友情与青春的Free!故事。