一间平凡无奇的咖啡店,老板在打烊后回到二楼的住所,放松之际,突然被电脑萤幕中的自己给叫住,对方声称是来自两分钟后的自己。原来他的咖啡店和住所之间有两分钟的“时差”。
可是父亲突然神秘失踪,因为联络不上父亲而担心的千鹤决定女扮男装前往京都探访。在那里,她所看见的是,与饥渴地寻求鲜血的妖怪所战斗并制伏他们的新选组的队士们。千鹤与新选组结下了奇妙缘分,并因缘际会之下加入了新选组。在搜索失踪父亲的主人公面前,出现了神秘的刺客们,逐渐明朗化地新选组的秘密——罗刹的存在。 在狂暴的时代中,在幕末争斗的背后,胸中挥舞着理想与信念之刃的男人们,与黑暗的战斗也拉开了序幕......