与此同时,来自国外的红发学生明日香(宫村洋子配音)和玲博丽(林惠美配音)一分为二,以姐妹身份出现,给Ikari真嗣的学校生活带来了巨大的变化。此外,原作中高大帅气的原型也将以娇小可爱的形象作为学院的一部分出现在动画中。该动画以《新世界福音战士》中的人物为原型,取代了原作沉重严肃的氛围,描绘了轻松愉快的校园生活。制作团队首次采用3D Q版设计,搭配逼真的背景和2D拼接,创造出多样化的绘画风格。
在杀死108个敌人后,真吉纳可以获得转世成佛的资格。神田死后,他的养子卡辛·旺日(也由Yuran Tata配音)继承了神田和三京那之间的合同。后来,可爱成熟的Tense Hayashi(菊地美香配音)、温柔可亲的Yamashin Izuki(中村拓世配音)和成熟冷静的Far Okami(Yumu Bi配音)等相继出现在Kashin Wangri的身边,他们的共同敌人“七星”再次开始运作。