作为帝国的王子,鲁鲁修为了建立一个人人平等的世界和妹妹娜娜丽的幸福世界,利用GEASS这一绝对服从的力量,带领黑骑士团向帝国宣战。他戴着假面具,化名ZERO,但在一年前的“东京决战”中被他的朋友朱雀击败,他的记忆被天皇抹去。现在,正在恢复记忆的路路修不仅需要面对帝国强大的军事力量,还需要面对虚伪的弟弟罗洛、失踪的妹妹娜娜丽、中国联盟不为人知的敌人和朋友,以及黑骑士的内部分裂。面对内忧外患,鲁鲁修踏上了GEASS权力的诅咒——国王的孤独之路。
杰森·伯恩事件引发了连锁反应,Treadstone计划和中央情报局利用药物管制加强特工的做法在报纸上公开,导致背后的人坐立不安。为了防止失去一切的情况,中央情报局高层决定暂停该计划,并将相关特工和科学家从行动中清除。