喜欢神秘事物的东树自然很快乐，但科罗的脑海里充满了入侵地球的事情。他们在那里发现了废墟，因为迷路了，但后来由于意外情况不得不逃离那里。但就在这时，东树看到一个女孩在一瞬间迷失了方向。抱着女孩的神秘感，东树和科若罗回到了东京。但就在这时，最强大的敌人出现在他们面前。它看起来和KERORO一样，但与KERORO不同的是，他想迅速彻底地计划入侵地球的黑暗KERORO。他率领部下CIBABA、DORURURU和MIRURU在世界各国发动侵略行动。与这一切作斗争的科罗队的命运是什么
两个失去亲人的少年与一位能看见精灵的少女“有星多江”，以及“须大叔”、“猫又”、“河童”、“座敷童子”等善良可爱的精灵妖怪，一起踏上了寻找亲人的冒险之路，小伙伴们温暖感人的友情故事也就此展开。即使山川异域，跨越时空，这份友情也决不能忘记！
